Количество товаров считается по разделу Товары - Склад.
Существующие, но не выставленные на витрину товары - учитываются при подсчете.
Скрытые с сайта товары - учитываются.
Товары, помещенные в корзину удаленных - не учитываются.
Несколько модификаций одного товара считаются одним товаром.
Чтобы товар не учитывался в итоговом количестве товаров в магазине нужно его удалить через раздел Товары - Склад. Товар необходимо отметить галкой и в выпадающем списке Действия с отмеченными товарами выбрать Удалить:
